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使用蛋白质语言模型和生物物理参数预测抗体非特异性

期刊:MAbs;PubMed ID:42200306。

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已翻译medical literature metadata英文原文2026-06-05

治疗性抗体的开发需要优化靶标结合亲和力和药效学,同时确保较高的可开发性潜力,包括尽量减少非特异性结合。本研究通过两种互补方法来预测抗体非特异性,从而应对这一问题:(1)基于蛋白质语言模型(PLMs)的抗体序列嵌入;(2)一套全面的基于序列的生物物理描述符。我们将 PLM 嵌入与可解释的、由序列衍生的生物物理描述符进行基准比较,并使用片段特异性模型(可变重链(VH)和可变轻链(VL)、串联区域以及单个互补决定区(CDRs))来识别功能性抗体中决定非特异性的区域层面因素,这些抗体可结合明确靶标。这些模型基于此前发表的人源和小鼠抗体数据进行训练,并且 t

原文标题

Prediction of antibody non-specificity using protein language models and biophysical parameters.