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Gemma 模型如何帮助发现新的潜在癌症治疗通路

我们推出基于 Gemma 开放模型家族、用于单细胞分析的全新 270 亿参数基础模型。

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已翻译official company source英文原文2025-10-23

Gemma 模型如何帮助发现新的潜在癌症治疗通路

2025 年 10 月 15 日

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我们推出基于 Gemma 开放模型家族、用于单细胞分析的全新 270 亿参数基础模型。

正文:Shekoofeh Azizi
员工研究科学家、研究负责人,Google DeepMind
正文:Bryan Perozzi
高级员工研究科学家,图挖掘,Google Research
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一般摘要

Google DeepMind 与 Yale 创建了 C2S-Scale,这是一个基于 Gemma 开放模型家族的新模型。该模型识别出一种药物组合,可能使肿瘤更容易被免疫系统识别,从而提供一种新的癌症治疗思路。研究人员现在可以访问该模型和相关资源,在此工作的基础上继续研究。

Summaries were generated by Google AI. Generative AI is experimental.

要点

本文讨论了 C2S-Scale,这是一种帮助发现潜在癌症治疗通路的新 AI 模型。C2S-Scale 基于 Google 的 Gemma 构建,预测出一种药物组合可增强“冷”肿瘤中的免疫信号。实验室测试证实了模型预测:silmitasertib 与 interferon 可放大抗原呈递。这一发现为使肿瘤更容易被免疫系统识别提供了新思路。C2S-Scale 模型和相关资源现已向研究人员开放,供其探索和进一步开发。

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A dark blue and black abstract slide featuring a large, blurred cell-like structure in the center. The text "Cell2Sentence Scale 27B" is in white. The word "Gemma" is visible in the bottom right corner.

今天,作为我们与 Yale University 研究合作的一部分,我们发布 Cell2Sentence-Scale 27B(C2S-Scale),这是一种全新的 270 亿参数基础模型,旨在理解单个细胞的语言。C2S-Scale 基于 Gemma 开放模型家族构建,代表了单细胞分析的新前沿。

这一公告标志着 AI 在科学领域的一个里程碑。C2S-Scale 生成了一个关于癌症细胞行为的新假设,我们随后通过活细胞中的实验验证确认了它的预测。这一发现揭示了一条有前景的、用于开发抗癌疗法的新通路。

此次发布建立在我们今年早些时候工作的基础之上,当时我们证明了生物模型遵循明确的缩放定律——就像自然语言一样,更大的模型在生物学任务上表现更好。这项工作提出了一个关键问题:更大的模型只是更擅长现有任务,还是能够获得全新的能力?扩展规模的真正前景在于创造新想法,以及发现未知。

C2S-Scale 27B 的工作原理

癌症免疫治疗中的一个主要挑战是,许多肿瘤是“冷”的——对人体免疫系统不可见。使其变“热”的一项关键策略,是迫使它们通过称为抗原呈递的过程展示触发免疫反应的信号。

Artist’s visualization of “cold” immune-context-neutral tumor cells that are invisible to the body’s immune, and “hot” immune-context-positive cells with more visible surface antigens.

我们给新的 C2S-Scale 27B 模型布置了一项任务:寻找一种作为条件性放大器发挥作用的药物,即只在特定“免疫背景阳性”环境中增强免疫信号;在这种环境中,低水平的 interferon(一种关键免疫信号蛋白)已经存在,但不足以单独诱导抗原呈递。这需要一种条件推理水平,似乎是规模带来的涌现能力;我们较小的模型无法解析这种依赖背景的效应。

为实现这一点,我们设计了一个双背景虚拟筛选,以寻找这种特定的协同效应。该虚拟筛选包括两个阶段:

  1. 免疫背景阳性:我们向模型提供了保留肿瘤—免疫相互作用且具有低水平 interferon 信号的真实患者样本。
  2. 免疫背景中性:我们向模型提供了没有免疫背景的分离细胞系数据。

随后,我们在两种背景下模拟了 4,000 多种药物的作用,并要求模型预测哪些药物只会在第一种背景中增强抗原呈递,以使筛选偏向与患者相关的环境。在模型标出的众多候选药物中,一部分(10–30%)药物命中项已在既往文献中被认识,而其余药物则是令人意外的命中项,此前并无已知关联。

从预测到实验验证

模型的预测很明确。它发现了激酶 CK2 抑制剂 silmitasertib(CX-4945)一个显著的“背景分裂”。模型预测,当 silmitasertib 应用于“免疫背景阳性”环境时,抗原呈递会显著增加;但在“免疫背景中性”环境中几乎没有或没有影响。令这一预测如此令人兴奋的是,它是一个新颖想法。尽管 CK2 已被认为涉及许多细胞功能,包括作为免疫系统调节因子,但文献中尚未报道通过 silmitasertib 抑制 CK2 会明确增强 MHC-I 表达或抗原呈递。这表明模型生成的是一个新的、可检验的假设,而不只是重复已知事实。

然而,预测只有在能够在临床应用中得到验证时才有价值。真正的检验首先在实验室中进行,最终则在临床中进行。

在项目的下一阶段,我们把这一假设带到实验台,并在人类神经内分泌细胞模型中进行了测试——这种细胞类型在模型训练期间完全未见过。实验显示:

  • 仅用 silmitasertib 处理细胞对抗原呈递(MHC-I)没有影响。
  • 仅用低剂量 interferon 处理细胞产生了适度影响。
  • 同时使用 silmitasertib 和低剂量 interferon 处理细胞,产生了显著的、协同放大的抗原呈递。

值得注意的是,在我们的实验室测试中,silmitasertib 与低剂量 interferon 的组合使抗原呈递大约增加了 50%,这会使肿瘤更容易被免疫系统识别。

模型的计算机模拟预测在体外多次得到确认。C2S-Scale 成功识别出一种新的 interferon 条件性放大器,揭示了一条使“冷”肿瘤变“热”、并可能对免疫治疗更有反应的新潜在通路。尽管这只是早期的第一步,但它为开发新的联合疗法提供了一个强有力且经过实验验证的线索;联合疗法使用多种药物协同作用,以实现更稳健的效果。

这一结果还为一种新的生物学发现方式提供了蓝图。它表明,通过遵循缩放定律并构建 C2S-Scale 27B 这样更大的模型,我们可以创建足够强大的细胞行为预测模型,用于开展高通量虚拟筛选、发现受背景条件影响的生物学现象,并生成具有生物学依据的假设。

Yale 的团队目前正在探索此处揭示的机制,并在其他免疫背景中测试更多由 AI 生成的预测。通过进一步的临床前和临床验证,这类假设最终或许能够加速通向新疗法的路径。

开始使用 C2S-Scale 27B

新的 C2S-Scale 27B 模型及其资源今天已面向研究社区开放。我们邀请你探索这些工具,在我们的工作基础上继续推进,并帮助我们继续翻译生命的语言。

  • 阅读 bioRxiv 上的完整科学预印本。
  • 在 Hugging Face 上探索模型和资源。
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发布于:
  • AI 产品
  • 健康

原文标题

How a Gemma model helped discover a new potential cancer therapy pathway